氏名
三中 信宏(みなか のぶひろ) Minaka, Nobuhiro
所属・職名
生態系計測研究領域 上席研究員
現在の研究内容
主として,生物統計学と進化生物学に関心を持っている.とくに,系統推定と生物分類に関わる理論的問題を中心に研究を進めている.現在は,遺伝子の配列情報に基づく巨大系統樹推定の方法論と高速なコンピュータ・プログラムの開発などに従事している.
履歴
1958年2月27日 京都市生まれ(57歳)
1980年3月 東京大学農学部農業生物学科卒業
1985年3月 東京大学大学院農学系研究科博士課程修了(農学博士:博農第827号)
1989年10月 農林水産省・農業環境技術研究所 研究員
1990年10月 農林水産省・農業環境技術研究所 主任研究官
2004年10月 独立行政法人・農業環境技術研究所・地球環境部・生態システム研究グループ研究リーダー
2006年4月 独立行政法人・農業環境技術研究所・生態系計測研究領域 上席研究員
2006年4月 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物・環境工学専攻 エコロジカル・セイフティー学講座 生態系計測学研究室 教授[連携大学院]
2007年4月 東京農業大学大学院 農学専攻 客員教授(応用昆虫学)[併任]
2008年4月 京都大学大学院理学研究科 連携併任教授(進化生物学)[2010年3月まで併任]
2015年4月 国立研究開発法人・農業環境技術研究所・生態系計測研究領域 上席研究員
現在にいたる
連絡先
minaka@affrc.go.jp
ホームページ
http://www.naro.affrc.go.jp/archive/niaes/minaka/
学問的活動
- 受賞:1993年度日本生物地理学会賞受賞(首席),2003年度日本進化学会・教育啓蒙賞.
- 学会などの役職:日本生物地理学会副会長,日本進化学会事務幹事長・評議員,日本計量生物学会理事,国際系統進化生物学機構(IOSEB)Council Member,日本学術会議研究連絡委員会委員(1991〜2000年),The Willi Hennig Society Fellow.
- メーリングリストの運営:進化生物学メーリングリスト(EVOLVE:会員数2500名余),生物統計学メーリングリスト(BIOMETRY:会員数1000名余),生物分類学メーリングリスト(TAXA:会員数1000名余),など.
- 客員教員・非常勤講師など:京都大学大学院理学研究科連携併任教授(進化生物学),東京農業大学大学院農学専攻客員教授(応用昆虫学),農林水産技術会議事務局主催(現・農研機構主催)数理統計短期集合研修,筑波国際農業研修センター(統計分析),その他:北海道大学,茨城大学,静岡大学,東京大学,首都大学東京,千葉大学,立正大学,信州大学,富山大学,名古屋大学,京都大学,九州大学,ならびに都道府県の農林水産関係試験研究機関における非常勤講義を担当(生物統計学,生物体系学).
最近の業績(過去10年間)
(英文原著論文[査読あり])
- Yuki Mitsui, Michihiko Shimomura, Kenji Komatsu, Nobukazu Namiki, Mari Shibata-Hatta, Misaki Imai, Yuichi Katayose, Yoshiyuki Mukai, Hiroyuki Kanamori, Kanako Kurita, Tsutomu Kagami, Akihito Wakatsuki, Hajime Ohyanagi, Hiroshi Ikawa, Nobuhiro Minaka, Kunihiro Nakagawa, Yu Shiwa and Takuji Sasaki: The radish genome and comprehensive gene expression profile of tuberous root formation and development. Scientific Reports, 5: 10835; doi: 10.1038/srep10835 (2015)
- Nobuhiro Minaka: Tree and network in systematics, philology, and linguistics – Structural model selection in phylogeny reconstruction. Senri Ethnological Studies, National Museum of Ethnology, Osaka. [in press] (2015)
- Hisakazu Matsumura, Hiroshi Kitajima, Shinji Akada, Jun Abe, Nobuhiro Minaka, Ryoji Takahashi: Molecular cloning and linkage mapping of cryptochrome multigene family in soybean. The Plant Genome, 2(3): 271-281 (2009.11)
- Majid OLIA, Wasim AHMAD, Masaaki ARAKI and Nobuhiro MINAKA: Molecular characterisation of some species of Mylonchulus (Nematoda: Mononchida) from Japan and comments on the status of Paramylonchulus and Pakmylonchulus. Nematology, 11(3): 337-342. (2009.5)
- Majid Olia, Wasim Ahmad, Masaaki Araki, Nobuhiro Minaka, Hirosuke Oba and Hiroaki Okada:Actus salvadoricus Baqri and Jairajpuri (Monochida: Mylonchulidae) from Japan with comment on the phylogenetic position of the genus Actus based on 18S rDNA sequences. Japanese Journal of Nematology, 38(2):57-69. (2008.12)
- Takahashi, R., H. Matsumura, S. Watanabe, K. Harada, M. Senda, S. Akada, S. Kawasaki, E. Doubouzet and N. Minaka:Molecular linkage mapping and phylogeny of chalcone synthase multigene family in soybeen. Theoretical and Applied Genetics, 110: 1203-1209. (2005.3)
(英文著書[査読あり])
- Nobuhiro Minaka: Chain, tree, and network – The development of phylogenetic systematics in the context of genealogical visualization and information graphics. In: David M. Williams, Quentin D. Wheeler, and Michael Schmitt (eds.), The Future of Phylogenetic Systematics – The Legacy of Willi Hennig. Cambridge University Press, Cambridge [in press] (2015)
(英文講演要旨)
- Minaka, N.:ACCTRAN is better than DELTRAN: Basic properties of ancestral character-state reconstruction [abstract]. Hennig XXXII: The 32th Annual Meeting of the Willi Hennig Society, 3-7 August 2013, Rostock, Germany, Abstracts p. 98(2013.8)
- Minaka, N.:Tree and network in systematics, philology, and linguistics – Structural model selection in phylogeny reconstruction [abstract]. The international symposium: Linguistic Relationships – Methodological Advances in Reconstructing the Past. 9-10 February 2013, National Museum of Ethnology, Osaka. (2013.2)
- Minaka, N.:The Gromov transform of phylogenetic diversity index and its statistical confidence test [abstract]. The International Biometric Conference, 26-31 August 2012, Kobe, Japan. Abstracts for the XXVIth International Biometric Conference, 26-31 August, 2012, Kobe, Japan. International Biometric Society(2012.8)
- Minaka, N.:Historical reasoning and abductive inference in phylogenetic reconstruction [abstract]. Hennig XXX, Sao Jose do Rio Preto, Sao Paulo, Brazil. Abstracts, p. 96. (2011.7-8)
- Minaka, N., T. Suemura, and K. Machii: Measuring phylogenetic diversity on cladograms: a new index based on the Gromov transform with reference to the root. [abstract] Cladistics, 26(2): 218. (2010.4)
- Minaka, N., T. Suemura, K. Okano, N. Sugiura, H. Yamamoto, K. Machii:Ancestral character-state reconstruction and its applications using BALANCE, an integrated software for calculating large phylogenies under the maximum parsimony criterion. [Abstract]. Cladistics, 24(1): 98-99. (2008.2)
(和文著書)
- 三中 信宏:『みなか先生といっしょに 統計学の王国を歩いてみよう:情報の海と推論の山を越える翼をアナタに!』羊土社,東京(2015.5)
- 三中 信宏:「生物の分類や進化は科学的に研究できるのか?」所収:山本貴光(編)『サイエンス・ブック・トラベル — 世界を見晴らす100冊』河出書房新社,pp.92-97(2015.3)
- マニュエル・リマ[三中 信宏訳]:『THE BOOK OF TREES — 系統樹大全:知の世界を可視化するインフォグラフィクス』ビー・エヌ・エヌ新社,東京(2015.3)
- 三中 信宏(監修)・杉山久仁彦(著):『生命の樹から系統樹へ/系統樹の森を逍遥して想うこと』,神戸芸術工科大学〈系統樹の森:芸術工学とインフォグラフィックス〉大阪展図録(2014.11)
- 三中 信宏:生物・言語・写本:系統推定論の歴史とその普遍性について.所収:松田隆美・徳永聡子(編著)『世界を読み解く一冊の本』,慶應義塾大学出版会[平成25年度極東証券寄付講座〈文献学の世界〉],東京, pp. 219-239.(2014.10)
- キャロル・K・ヨーン[三中 信宏・野中香方子訳]『自然を名づける:なぜ生物分類では直感と科学が衝突するのか』NTT出版,東京(2013.9)
- 三中 信宏:成長と進化思考.所収:高桑和巳(編)『成長:生命の教養学IX』(分担執筆),慶應義塾大学出版会,東京, pp. 223-250.(2013.9)
- 三中 信宏(文)・杉山久仁彦(図版):『系統樹曼荼羅:チェイン・ツリー・ネットワーク』NTT出版,東京.(2012.11)
- 三中 信宏(編著):別冊日経サイエンス185号『進化が語る 現在・過去・未来』日経サイエンス社,東京(2012.6)
- 中尾 央・三中 信宏(編著):『文化系統学への招待:文化の進化パターンを探る』勁草書房,東京,(2012.5)
- 三中 信宏:日本進化学会(編)『進化学事典』共立出版.項目執筆と編集作業.担当項目:種概念(pp. 762-765),分類学(pp. 872-877),生物地理学(pp. 891-895),形態測定学(pp 740-745),進化学の歴史(pp. 898-904),収斂(pp. 723-724).(2012.4)
- ハインツ・ホライス,矢沢 潔,三中 信宏,河田 雅圭,長野 敬:『眠れなくなる進化論の話:ダーウィン、ドーキンズから現代進化学まで全部みせます』,技術評論社,東京.(2012.1)
- 三中 信宏:系譜の存在パターンと進化の生成プロセス.Pp. 208-226[英文要旨,p. 336].所収:東浩紀(編)『思想地図β・第1巻』,コンテクチュアズ,東京.(2011.1)
- 三中 信宏:『進化思考の世界:ヒトは森羅万象をどう体系化するか』,NHK Books 1164(2010.9)
- 三中 信宏:系譜学的思考の起源と展開:系統樹の図像学と形而上学.Pp.141-161.所収:松本俊吉(編)『進化論はなぜ哲学の問題になるのか:生物学の哲学の現在』,勁草書房,東京. (2010.7)
- 三中 信宏:『過去を復元する:最節約原理・進化論・推論』(翻訳:Elliott Sober (1988), Reconstructing the Past: Parsimony, Evolution, and Inference)勁草書房,東京,318pp. (2010.4)
- 三中 信宏:『分類思考の世界:なぜヒトは万物を「種」に分けるのか』,講談社現代新書2014,東京(2009.9)
- 三中 信宏:『系統樹思考の世界:すべてはツリーとともに』,講談社現代新書1849,東京(2006.7)
(和文総説)
- 三中 信宏:昆虫分類学若手懇談会:40 年にわたる歴史から見えてくる展望.特集〈分類学の過去・現在・未来〉.Panmixia(昆虫分類学若手懇談会)no. 18: 3-9(2015.5)[印刷中]
- 三中 信宏:世界を覆い尽くす系統樹の森:グラフィクスとインフォマティクス.インベントリー(農業環境技術研究所)no. 12: 5-10(2014.9)pdf
- 三中 信宏:南方曼陀羅:世界を体系化するある思惟の図像的背景.特集〈南方熊楠:森の巨人がまいた胞子〉,科学(岩波書店),2013年8月号: 906-909(2013.8)CiNii | pdf
- 三中 信宏:知識の樹:図書分類と生物分類は共通のルーツをもつ. 現代の図書館,48(4): 262-269. (2011.1) CiNii
- 三中 信宏:生物多様性と「種」問題:分類する者と分類される物のはざまで. ビオストーリー(生き物文化誌学会),13: 21-27. (2010.6)
- 三中 信宏:分子系統学:最近の進歩と今後の展望. 植物防疫,63(3): 192-196. (2009.3) NDL | pdf
- 三中 信宏:幾何学的形態測定学:「かたち」の数理と統計の最前線. 日本数理生物学会ニュースレター,no. 57, pp. 6-13. (2009.2) pdf
- 三中 信宏:「種」概念の光と闇:概念の分類ではなく,その出自をたどろう.生物科学, 59(4): 238-243. (2008.5)
- 三中 信宏:進化生物学と統計科学:系統樹の推定をめぐって. 計量生物学,28(特別号1): S25-S34. (2007.10) CiNii | pdf
- 三中 信宏:科学哲学は役に立ったか:現代生物体系学における科学と科学哲学の相利共生. 科学哲学, 40(1): 43-54. (2007.7) CiNii | pdf
- 三中 信宏:サイエンスとアートのはざまで図像を読みとる:系統樹をめぐるリテラシー.InterCommunication, (60):62-73. (2007.2)
- 三中 信宏:進化学と生物学哲学の視線の交わり.遺伝・別冊(NTS), no. 20, pp. 144-145. (2007.1)
- 三中 信宏:Ernst Mayr と Willi Hennig:生物体系学論争をふたたび鳥瞰する.タクサ(日本動物分類学会和文誌), (19): 95-101(2005.8)CiNii | pdf
- 三中 信宏:新たなる「系統学革命」の波:普遍的思考としての生物進化について.InterCommunication, (53): 32-38. (2005.7)
- 三中 信宏:非生物だって進化する:歴史推定の普遍的方法論について.遺伝,59(1): 97-103(2005.1)