氏名

三中　信宏（みなか　のぶひろ）　Minaka, Nobuhiro

所属・職名

生態系計測研究領域　上席研究員

現在の研究内容

　主として，生物統計学と進化生物学に関心を持っている．とくに，系統推定と生物分類に関わる理論的問題を中心に研究を進めている．現在は，遺伝子の配列情報に基づく巨大系統樹推定の方法論と高速なコンピュータ・プログラムの開発などに従事している．

履歴

１９５８年２月２７日 京都市生まれ（５３歳）
１９８０年３月 東京大学農学部農業生物学科卒業
１９８５年３月 東京大学大学院農学系研究科博士課程修了（農学博士：博農第８２７号）
１９８９年１０月 農林水産省・農業環境技術研究所　研究員
１９９０年１０月 農林水産省・農業環境技術研究所　主任研究官
２００４年１０月 独立行政法人・農業環境技術研究所・地球環境部・生態システム研究グループ研究リーダー
２００６年４月 独立行政法人・農業環境技術研究所・生態系計測研究領域　上席研究員
２００６年４月 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物・環境工学専攻 エコロジカル・セイフティー学講座 生態系計測学研究室　教授［連携大学院］
２００７年４月　東京農業大学大学院 農学専攻　客員教授（応用昆虫学）［併任］
２００８年４月　京都大学大学院理学研究科　連携併任教授（進化生物学）［２０１０年３月まで併任］
現在にいたる

連絡先

minaka@affrc.go.jp

ホームページ

http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/

学問的活動

• 受賞：１９９３年度日本生物地理学会賞受賞（首席），２００３年度日本進化学会・教育啓蒙賞．
• 学会などの役職：日本生物地理学会副会長，日本進化学会事務幹事長・評議員，日本計量生物学会理事，国際系統進化生物学機構（IOSEB）Council Member，日本学術会議研究連絡委員会委員（1991〜2000年），The Willi Hennig Society Fellow．
• メーリングリストの運営：進化生物学メーリングリスト（EVOLVE：会員数2200名余），生物統計学メーリングリスト（BIOMETRY：会員数1000名余），生物分類学メーリングリスト（TAXA：会員数900名余），など．
• 客員教員・非常勤講師など：京都大学大学院理学研究科連携併任教授（進化生物学），東京農業大学大学院農学専攻客員教授（応用昆虫学），農林水産技術会議事務局主催（現・農研機構主催）数理統計短期集合研修，筑波国際農業研修センター（統計分析），その他：北海道大学，茨城大学，静岡大学，東京大学，首都大学東京，千葉大学，立正大学，信州大学，富山大学，名古屋大学，京都大学，九州大学，ならびに都道府県の農林水産関係試験研究機関における非常勤講義を担当（生物統計学，生物体系学）．

最近の業績（過去15年間）

（原著論文）

• Minaka, N., T. Suemura, and K. Machii: Measuring phylogenetic diversity on cladograms: a new index based on the Gromov transform with reference to the root. [abstract] Cladistics, 26(2): 218. (2010.4)
• Hisakazu Matsumura, Hiroshi Kitajima, Shinji Akada, Jun Abe, Nobuhiro Minaka, Ryoji Takahashi: Molecular cloning and linkage mapping of cryptochrome multigene family in soybean. The Plant Genome, 2(3): 271-281 (2009.11)
• Majid OLIA, Wasim AHMAD, Masaaki ARAKI and Nobuhiro MINAKA: Molecular characterisation of some species of Mylonchulus (Nematoda: Mononchida) from Japan and comments on the status of Paramylonchulus and Pakmylonchulus. Nematology, 11(3): 337-342. （2009.5）
• Majid Olia, Wasim Ahmad, Masaaki Araki, Nobuhiro Minaka, Hirosuke Oba and Hiroaki Okada：Actus salvadoricus Baqri and Jairajpuri (Monochida: Mylonchulidae) from Japan with comment on the phylogenetic position of the genus Actus based on 18S rDNA sequences. Japanese Journal of Nematology, 38(2):57-69. (2008.12)
• Minaka, N., T. Suemura, K. Okano, N. Sugiura, H. Yamamoto, K. Machii:Ancestral character-state reconstruction and its applications using BALANCE, an integrated software for calculating large phylogenies under the maximum parsimony criterion. [Abstract]. Cladistics, 24(1): 98-99. (2008.2)
• Takahashi, R., H. Matsumura, S. Watanabe, K. Harada, M. Senda, S. Akada, S. Kawasaki, E. Doubouzet and N. Minaka：Molecular linkage mapping and phylogeny of chalcone synthase multigene family in soybeen. Theoretical and Applied Genetics, 110: 1203-1209. (2005.3)
• Minaka, N., T. Suemura, T. Asano, H. Yamamoto and K. Machii: BOGEN: An improved software for estimating larger Steiner trees in phylogenetics [abstract]. Cladistics, 20(6): 601. (2004.12)
• Minaka, N., T. Suemura, T. Asano, H. Yamamoto and K. Machii: BOGEN: A faster parsimony program for computing larger phylogenetic trees [abstract]. Cladistics, 20(1): 89. (2004.2)
• Minaka, N., H. Yamamoto, T. Asano, T. Suemura and K. Machii: A more efficient heuristic algorithm for the large phylogenetic Steiner problem [abstract]. Cladistics, 19: 157.（2003.5）
• Minaka, N.：Quantitative comparison of parsimoniously reconstructed ancestral character-states in a cladogram [abstract]. Cladistics, 18(2): 227 (2002.10)
• Fujiwara, S.*, M. Kawachi*, N. Minaka, I. Inouye* and M. Tsuzuki： Molecular phylogeny of the Prymnesiophyta based on the rbcL gene and sequence variation in the spacer region of the RuBisCO operon. Journal of Phycology, 37: 121-129. (2001.5)
• Kanematsu, S., N. Minaka, T. Kobauashi, A. Kudo and Y. Ohtsu：Molecular Phylogenetic Analysis on Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer Regions and Comparison of Fertility in Phomopsis Isolates from Fruit Trees. Journal of General Plant Pathology 66(3): 191-201 (2000.8)
  
• Morinaka, S., N. Minaka, M. Sekiguchi, E. Erniwati, S.N. Prijono, I.K. Ginarsa and T. Hidaka： Molecular phylogeny of birdwing butterflies of the tribe Troidini (Lepidoptera: Papilionidae) - using all species of the genus Ornithoptera. Biogeography, 2: 103-111. [2000.10]
• Reyment, R.A. and N. Minaka：A note on reiterated phenotypes in species of Neogastroplites (Ammonoidea, Cenomanian, Cretaceous). Cretaceous Research, 21: 173-175. (2000.7)
• Sameshima, S., E. Hasegawa, O. Kitade, N. Minaka and T. Matsumoto：Phylogenetic comparison of endosymbionts with their host ants based on molecular evidence. Zoological Science, 16: 993-1000. (1999.12)
• Fujita, N., A. Kubo, P.B. Francisco, M. Nakakita, K. Harada, N. Minaka and Y. Nakamura：Purification, characterization and cDNA structure of isoamylase from developing endosperm of rice. Planta, 208: 283-293.(1999.4)
• Masuchi, Y., A. Sugai, N. Minaka, Y.H. Itoh, T. Itoh, I. Karube：Isoprenoid synthesis gene for geranylgeranyl diphosphate synthase from a hyperthermophile, Pyrococcus sp. strain OT3. Journal of Marine Biotechnology, 6(4): 201-205 (1998.10)
• Shimamoto, I., P. Vazquez, S. Sonoda, N. Minaka and M. Nishiguchi： Nucleotide sequence analysis of the 3' terminal region of a wasabi strain of tomato mosaic vieus (TMV-W) genomic RNA: subgrouping of crucifer tobamoviruses. Archive of Virology, 143: 1801-1813 (1998.10)
• Toriyama, S., T. Kimishima, M. Takahashi, T. Shimizu, N. Minaka and K. Akutsu：The complete nucleotide sequence of the rice grassy stunt virus genome and genomic comparisons with viruses of the genus Tenuivirus. Journal of General Virology, 79: 2051-2058 (1998.8)
• Minaka, N.：Classification and phylogeny: cognitive taxonomy and inferential phylogenetics. Actinomycetologica, 10(2): S1-S2 (1996.12)
• Chikuni, K., N. Minaka and H. Ikenaga. 1996. Molecular phylogeny of the Passeriformes, based on the cytochrome b sequences. Journal of Yamashina Institute for Ornithology, 28(1): 1-8 (1996.3)
• Hanazawa, M., H. Narushima and N. Minaka: Generating most parsimonious reconstructions on a tree: a generalization of the Farris-Swofford-Maddison method. Discrete Applied Mathematics, 56:245-265(1995.3)
• Fujiwara, S., M. Sawada, J. Someya, N. Minaka, M. Kawachi and I. Inouye：Molecular phylogenetic analysis of rbcL in the Prymnesiophyta. Journal of Phycology, 30: 863-871. (1994.12)
• Minaka, N.：Algebraic properties of the most parsimonious reconstructions of the hypothetical ancestors on a given tree. Forma, 8(2):277-296. (1993.12)
• Fujiwara, S., H. Iwahashi, J. Someya, S. Nishikawa and N. Minaka：Structure and cotranscription of the plastid-encoded rbcL and rbcS genes of the marine haptophyte, Pleurochrysis carterae. Journal of Phycology, 29: 347-355.(1993.6)

（総説）

• 三中 信宏：知識の樹：図書分類と生物分類は共通のルーツをもつ. 現代の図書館，48(4): 262-269. (2011.1)
• 三中 信宏：生物多様性と「種」問題：分類する者と分類される物のはざまで. ビオストーリー（生き物文化誌学会），13: 21-27. (2010.6)
• 三中 信宏：分子系統学：最近の進歩と今後の展望. 植物防疫，63(3): 192-196. (2009.3)
• 三中 信宏：幾何学的形態測定学：「かたち」の数理と統計の最前線. 日本数理生物学会ニュースレター，no. 57, pp. 6-13. (2009.2)
• 三中 信宏：生物の樹・科学の樹［14回連載記事］．本（講談社）, 32(7)〜33(8). (2007.6〜2008.8)
• 三中 信宏：「種」概念の光と闇：概念の分類ではなく，その出自をたどろう．生物科学, 59(4): 238-243. (2008.5)
• 三中 信宏：進化生物学と統計科学：系統樹の推定をめぐって. 計量生物学，28（特別号1）: S25-S34. (2007.10)
• 三中 信宏：科学哲学は役に立ったか：現代生物体系学における科学と科学哲学の相利共生. 科学哲学, 40(1): 43-54. (2007.7)
• 三中 信宏：サイエンスとアートのはざまで図像を読みとる：系統樹をめぐるリテラシー．InterCommunication, (60):62-73. (2007.2)
• 三中 信宏：進化学と生物学哲学の視線の交わり．遺伝・別冊（NTS）, no. 20, pp. 144-145. (2007.1)
• 三中 信宏：Ernst Mayr と Willi Hennig：生物体系学論争をふたたび鳥瞰する．タクサ（日本動物分類学会和文誌）, (19): 95-101（2005.8）
• 三中 信宏：新たなる「系統学革命」の波：普遍的思考としての生物進化について．InterCommunication, (53): 32-38. (2005.7)
• 三中 信宏：非生物だって進化する：歴史推定の普遍的方法論について．遺伝，59(1): 97-103（2005.1）
• 三中 信宏：進化学−ヘッケル『生命の不可思議』からグールド『ワンダフル・ライフ』まで. 遺伝, 55(5): 76-84 (2001.9)
• 三中 信宏：樹は何を語り始めるのか？：進化的思考の人間観への関わり. 生物学史研究, (67): 83-87. (2001.4)
• 三中 信宏：進化子の拡張，系統発生の一般化：ある「樹思考者」の立場から. InterCommunication, (36): 76-85 (2001.2)
• 三中 信宏：ヒトが種をつくる−種問題のもう一つの根本的解決(2). 生物科学, 51(4): 205-214. (2000.2)
• 三中 信宏：ヒトが種をつくる−種問題のもう一つの根本的解決(1). 生物科学, 51(3): 129-136. (1999.11)
• 三中 信宏：系統樹のグラフ理論：歴史は数理に通じること−系統学入門以前.ＪＡＭＢニュースレター（数理生物学懇談会）, (27): 4-30 (1999.1)
• 三中 信宏：最節約法に基づく分子系統樹推定：系統樹の森の探検. Japanese Journal of Biometrics（日本計量生物学会会報）, 19: 49-72 (1998.10)
• 三中 信宏：チャールズ・ダーウィン：自然誌と自然史のはざまで. 科学, 68(12): 927-930. (1998.12)
• 三中 信宏：分子系統学の農学への応用：ＤＮＡ分子情報に基づく系統関係の推定. 農業技術, 53(8): 22-27. (1998.7)
• 三中 信宏：歴史の複雑性と原理の単純性：生物系統学の観点から. 現代思想, 24(13): 170-178. (1996.10)
• 三中 信宏：分岐分類学に基づく形質進化の最節約復元. 種生物学研究,(19):39-49(1995.12)
• 三中 信宏：コンピュータ集中型統計学に基づく誤差推定. 日本動物行動学会ニュースレター, (27):4-15 (1995.12)
• 三中 信宏：分岐分類学の生物地理学への適用：分岐図，成分分析および最節約原理. 日本生物地理学会会報, 48(2): 1-27. (1993.12)
• 三中 信宏：歴史生物地理学における分断概念：地域分岐図の構築に関する系統推定論上の問題点. 植物分類・地理, 44(2): 151-184. (1993.12)
• 三中 信宏：組合せ論的視点から見た系統推定：最節約法と離散数学の接点.　千葉県立中央博物館自然誌研究報告, 2(2): 83-98. (1993.3)

（著書）

• 三中 信宏：系譜の存在パターンと進化の生成プロセス．Pp. 208-226［英文要旨，p. 336］．所収：東浩紀（編）『思想地図β・第1巻』，コンテクチュアズ，東京．（2011.1）
• 三中 信宏：『進化思考の世界：ヒトは森羅万象をどう体系化するか』，NHK Books 1164（2010.9）
• 三中 信宏：系譜学的思考の起源と展開：系統樹の図像学と形而上学．Pp.141-161．所収：松本俊吉（編）『進化論はなぜ哲学の問題になるのか：生物学の哲学の現在』，勁草書房，東京． (2010.7)
• 三中 信宏：『過去を復元する：最節約原理・進化論・推論』（翻訳：Elliott Sober (1988), Reconstructing the Past: Parsimony, Evolution, and Inference）勁草書房，東京，318pp. (2010.4)
• 三中 信宏：『分類思考の世界：なぜヒトは万物を「種」に分けるのか』，講談社現代新書2014，東京（2009.9）
• 三中 信宏：『系統樹思考の世界：すべてはツリーとともに』，講談社現代新書1849，東京（2006.7）
  
• 三中 信宏：日本育種学会（編）『植物育種学辞典』（進化・系統学関連項目の分担執筆），培風館（2005.9）
  
• 三中 信宏：山岸哲他（編）『鳥類学辞典』（進化・系統学関連項目の分担執筆），昭和堂出版（2004.9）
  
• 三中 信宏：『新農学大事典』（生物統計学関連項目の分担執筆）. 養賢堂, 東京 (2004.5)
• 三中 信宏：生物形態とその変形をどのように定量化するか：幾何学的形態測定学への道. Pp.313-328. 所収：関村利朗・野地澄晴・森田利仁（編）『生物の形の多様性と進化：遺伝子から生態系まで』（裳華房, 東京）(2003.6)
  
• 三中 信宏：『医学大辞典』（進化・系統学関連項目の分担執筆）. 医学書院, 東京 (2003.3)
• 三中 信宏・鈴木 邦雄：生物体系学におけるポパー哲学の比較受容. 所収：日本ポパー哲学研究会（編），『批判的合理主義・第２巻：応用的諸問題』, pp.71-124. 未來社，東京. (2002.8)
• 三中 信宏：「複雑系の事典」編集委員会（編）『複雑系の事典：適応複雑系のキーワード１５０』（進化学関連項目の分担執筆），朝倉書店，東京. (2001.1)
• 長谷川眞理子・三中 信宏・矢原徹一：『現代によみがえるダーウィン』，ダーウィン著作集第１期・別巻１, 文一総合出版, 東京, 263 pp. (1999.4)
• 三中 信宏：分岐分析. 所収：『新版・微生物学実験法』, 講談社サイエンティフィック, 東京, pp.249-252.(1999.3)
• 三中 信宏：形態測定学. 所収：『古生物の科学』第２巻（棚部一成・森啓編, 朝倉書店, 東京）, 古生物の形態と解析, pp.61-99.(1999.12)
• 三中 信宏：『生物系統学』 東京大学出版会, 東京, xiv+458pp. (1997.12)
• 渡辺 政隆・三中 信宏：『ニワトリの歯：進化論の新地平』（上・下）（翻訳：Stephen J. Gould(1983), Hen's Teeth and Horse's Toes: Further Reflections in Natural History）早川文庫(NF 219,220), 早川書房, 東京, 310+326pp. (1997.11)
• 三中 信宏：生命工学・生物科学における研究の現状と問題点. 農林水産技術会議事務局（編）『農林水産業の高度情報システム−農林水産業における高度情報システム開発に関する調査委員会報告書』, 農林水産技術情報協会、東京, pp.26-45 ならびに CD-ROM. (1996.10)
• 三中 信宏：『過去を復元する：最節約原理・進化論・推論』（翻訳：Elliott Sober (1988), Reconstructing the Past: Parsimony, Evolution, and Inference）蒼樹書房、東京、318pp. (1996.7)
• 三中 信宏：分岐分析にもとづく系統推定の論理とその応用：系統樹推定と祖先形質復元. 所収：『動物の自然史：現代分類学の多様な展開』（馬渡峻輔編，北海道大学図書刊行会，札幌）pp.183-203, 264-266 (1995.12)
• 三中 信宏・斎藤 成也：最大節約法. Pp.380-395：『新生化学実験講座第16巻：分子進化実験法』所収. 東京化学同人.　(1993.3)