研究者情報 (国立研究開発法人農業環境技術研究所)
2015年4月現在
氏名
岡田 浩明(おかだ ひろあき) Okada, Hiroaki
所属・職名
生物生態機能研究領域主任研究員
現在の研究内容
線虫(nematode)の生態を研究しています。線虫というと寄生虫の1種で、動植物の体内で悪いことをするというイメージを持つ方が多いと思います。でも、線虫は多様です。寄生せずに自由生活を送る種もたくさんいます。そうした線虫を対象(材料)にして、現在次のような研究をしています。
1)地球温暖化が水田土壌の食物網に及ぼす影響の解明
FACE(開放形CO2濃度増加装置)を設置した水田圃場で調査し、土壌中の植物バイオマス、微生物、線虫群集からなる食物網に及ぼす50年後の温暖化(CO2濃度及び気温の増加)の影響を解明し、水田に生息する生物への温暖化の将来予測に役立てようとしています。
*なぜ線虫を調べるのか?
欧米や中国などでは、線虫の密度や群集構造を調べることで、温暖化や攪乱による生態系への影響を評価使用とする研究が盛んです。なぜ線虫なのでしょうか? 主な理由は、「そこに線虫がいるから」です。単純ですが重要なことです。線虫は陸域土壌のみならず湖沼や海洋の底にもたくさんいるのです。一方、プランクトンは水中にしか、トビムシやササラダニは土壌中にしかいません(例外はあります)。線虫は水陸を問わず生息するのです。他にも線虫には次のような利点があります。
(1)耕起や農薬散布などの攪乱にも強く、慣行管理の田畑でも高密度になること。一方、ミミズは耕起すると一般に激減します。
(2)少量の土壌からたくさん採れるので小規模の実験ができること。10gの土壌から20−200匹採れます。
(3)種ごとに植物食、細菌食、カビ食などに分けられるので、植物や微生物を通じた生態系内の養分やエネルギーの流れを反映するといわれること。植物や微生物のバイオマスをいちいち調べるのは大変です。
(4)線虫自体が水域では魚の、陸域ではダニやクマムシなどの餌となり、上位の食物網を支えること。
詳しくは(解説・総説など)の4や12の文献をご覧下さい。
他にも近年次のような研究を行っています(いました)。
2)畑における栽培管理様式が植物寄生性線虫の発生に及ぼす影響の解明
栽培管理を工夫することで、植物寄生性線虫による野菜の被害を抑えられるでしょうか?査読論文9、18などです。
3)DNAベースでの線虫群集分析法の開発
顕微鏡を使わずに群集構造を分析するための技術の開発です。解説・総説などの6、8、10などです。
4)個々の線虫種の特性や、線虫と他の生物との相互作用の解明
線虫の生態学を支える基礎研究です。査読論文20、22などです。
研究経歴
1991: 農水省東北農業試験場畑病虫害研究室研究員、翌年より線虫の研究を開始。
1998-2000: カリフォルニア大学デービス校線虫学科客員研究員。
2004: 農業環境技術研究所へ異動、現職。
2005: 農学博士号取得。
ReaD 研究者情報
http://jglobal.jst.go.jp/detail.php?JGLOBAL_ID=200901046641103550
今までの主な業績:2005年以降
(査読論文)
- Matsushita,Y., Z. Bao, D. Kurose, H. Okada, S. Takemoto, A. Sawada, H. Nagase, M. Takano, H. Murakami, M. Koitabashi, S. Yoshida, M. Saito, T. Sano, S. Tsushima. Community structure, diversity, and species dominance of bacteria, fungi, and nematodes from naturally and conventionally farmed soil: a case study on Japanese apple orchards. Organic Agriculture,5: 11-28.
- 長瀬 陽香、丹羽 理恵子、松下 裕子、池田 健太郎、山岸 菜穂、串田 篤彦、岡田浩明、吉田 重信、對馬 誠也. 圃場におけるハクサイ黄化病発生程度とPCR-DGGE法に基づく土壌微生物相の関係, 日本植物病理学会報, 81: 9-21.
- Hiroaki Okada, Hidemitsu Sakai, Takeshi Tokida, Yasuhiro, Usui, Hirofumi Nakamura and Toshihiro Hasegawa (2014) Elevated temperature has stronger effects on the soil food web of a flooded paddy than does CO2. Soil Biology & Biochemistry 70, 166-175.
- Hiroaki Okada and Hirosuke Oba (2012) Quantitative detection of nematodes by using PCR-DGGE for community similarity evaluation. Nematological Research 42 (2) 27-30.
- Zhihua Bao, Yoko Ikunaga, Yuko Matsushita, Sho Morimoto, Yuko Takada-Hoshino, Hiroaki Okada, Hirosuke Oba, Shuhei Takemoto, Shigeru Niwa, Kentaro Ohigashi, Chika Suzuki, Kazunari Nagaoka, Makoto Takenaka, Yasufumi Urashima, Hiroyuki Sekiguchi, Atsuhiko, Kushida, Koki Toyota, Masanori Saito, Seiya Tsushima (2012) Combined analyses of bacterial, fungal and nematode communities in Andosolic agricultural soils in Japan. Microbes and Environment 27, 1, 72-79.
- Hiroaki Okada, Shigeru Niwa, Shuhei Takemoto, Masakazu Komatsuzaki and Mikiya Hiroki. (2011) How different or similar are nematode communities between a paddy and an upland rice fields across a flooding-drainage cycle? Soil Biology & Biochemistry 43, 2142-2151.
- Takuo Sawahata, Hitoshi Nakamura, Hiroaki Okada, Atsuko Sasaki, and Satoko Kanematsu. (2012) Nonlethal ectoparasitism of the mycophagous nematode Filenchus discrepans (Nematoda: Tylenchidae). Nematology 14 (2), 159-164.
- Shuhei Takemoto, Shigeru Niwa and Hiroaki Okada (corresponding author) Effect of storage temperature on soil nematode community structures as revealed by PCR-DGGE. Journal of Nematology (米国線虫学会誌) 42: 324-331.
- Shigeru Niwa, Lucero Mariani, Nobuhiro Kaneko, Hiroaki Okada and Kazunori Sakamoto (2011) Early-stage impacts of sika deer on structure and function of the soil microbial food webs in a temperate forest: a large-scale experiment. Forest Ecology and Management 261, 391-399.
- Hiroaki Okada, Hiroaki Harada and Mana Nozaki (2010) Propagation of Aphelenchus avenae Bastian (Aphelenchidae) and Filenchus misellus Andrassy (Tylenchidae) on seven fungal isolates of Rhizoctonia solani as food source. Nematological Research 40, 2, 53-55.
- Nurul Karim, John T Jones, Hiroaki Okada and Taisei Kikuchi (2009) Analysis of expressed sequence tags and identification of genes encoding cell-wall-degrading enzymes from the fungivorous nematode Aphelenchus avenae. BMC Genomics 10: 525, doi: 10.1186/1471-2164-10-525
- 浦嶋泰文、中嶋美幸、金田哲、岡田浩明、長谷川浩、村上敏文 (2009) 有機農業実践圃場と慣行栽培圃場のリン脂質脂肪酸の実態、 土と微生物 63(2), 55-63.
- Hiroaki Okada,Hiroshi Hasegawa,Tomoyoshi Hashimoto,Hiroyuki Sekiguchi and Yasufumi Urashima (2009) Are community structures of soil nematodes different between organic and conventional farming systems in commercial tomato fields? Nematological Research 39: 63-71.
- Shuhei Takemoto and Hiroaki Okada (2009). Suppressed-priming PCR, a novel concept of DNA quantification based on PCR kinetics. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 73(9), 2121-2123.
- Wim Bert, Hiroaki Okada, Ines Tavernier, Gaetan Borgonie, Wouter Houthoofd (2010) Morphological, morphometrical and molecular characterisation of Filenchus fungivorus n. sp., a fungiphagous nematode from Japan in a most likely polyphyletic genus (Nematoda: Tylenchina). Nematology 12: 235-246.
- M. Takeda, T. Nakamoto, K. Miyazawa, T. Murayama, H. Okada (2009) Phosphorus availability and soil biological activity in an Andosol under compost application and winter cover cropping. Applied Soil Ecology 42(2), 86-95
- Majid Olia, Wasim Ahmad, Masaaki Araki, Nobuhiro Minaka, Hirosuke Oba and Hiroaki Okada (2008) Actus salvadoricus Baqri and Jairajpuri (Monochida: Mylonchulidae) from Japan with comment on the phylogenetic position of the genus Actus based on 18S rDNA sequences. Jpn. J. Nematol. 38, 57-69.
- Taizo Nakamori, Naoya Fujiwara, Naoyuki Matsumoto, Hiroaki Okada (2009) Collembolan fauna in arable land, including the first records of Mesaphorura silvicola (Folsom) from Japan. Edaphologia. 84, 5-9.
- Okada, H. and Oba, H. (2008) Comparison of nematode community similarities assessed by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) and by morphological identification. Nematology 5, 689-700.
- Hiroyuki Sekiguchi, Hiroshi Hasegawa, Hiroaki Okada, Atsuhiko Kushida and Shigehito Takenaka. (2008) Comparative Analysis of Environmental Variability and Fungal Community Structure in Soils between Organic and Conventional Commercial Farms of Cherry Tomato in Japan. Microbes and Environments 23: 57-65.
- Shigeru Niwa, Nobuhiro Kaneko, Hiroaki Okada, Kazunori Sakamoto. (2008) Effects of fine-scale simulation of deer browsing on soil micro-foodweb structure and N mineralization rate in a temperate forest. Soil Biology & Biochemistry 40 , 699-708.
- Okada, H. and Harada, H. (2007) Effects of tillage and fertilizer on nematode communities in a Japanese soybean field. Applied Soil Ecology. 35 (3), 582-598.
- 岡田浩明 (2006) 糸状菌食性線虫の生態及び植物病害抑制への利用. 東北農業研究センター研究報告. 第105号, 155-197.
- Okada, H., Harada, H., Tsukiboshi, T., Araki, A. (2005) Characteristics of Tylencholaimus parvus (Nematoda: Dorylaimida) as a fungivorus nematode. Nematology 7(6), 843-849.
- 門田育生,大藤泰雄、岡田浩明、石黒 潔、児玉勝雄、勝部和則、堀越紀夫、萩原 廣 (2005) リンドウ「こぶ症」発症株の根部に見られる生育障害. 北日本病害虫研究会報 56, 61-64.
- Okada, H., Harada, H., Kadota, I. (2005) Fungal-feeding habits of six nematode isolates in the genus Filenchus. Soil Biology & Biochemistry. 37(6) 1113-1120.
(総説・解説など。主なもののみ)
- 岡田浩明 (2015) 第2回日韓共同線虫学シンポジウム(Japan-Korea Joint Symposium on Nematology 2014), 日本線虫学会ニュース, 日本線虫学会, 64, 7-8.
- 岡田浩明(2015) [書評]Biological control of plant-parasitic Nematodes: Soil ecosystem management in sustainable agriculture (植物寄生性線虫の生物学的防除:持続的農業における土壌生態系管理), 日本線虫学会ニュース, 日本線虫学会, 64, 11-12.
- 岡田浩明(2015) 新刊紹介「線虫学実験」, どろのむし通信, 日本土壌動物学会, 63, 9.
- 岡田浩明 (2014) 第6回国際線虫学会プログラムとセッション.日本線虫学会 ニュース, 日本線虫学会, 9-11.
- 岡田浩明(2014) 書評「生態学者が書いたDNAの本 メンデルの法則から遺伝情報の読み方まで」.井鷺裕司・陶山佳久、文一総合出版, どろのむし通信, 61, 8-9.
- 岡田浩明(2013))第52回 米国線虫学会年次大会 (7月 米国) 参加報告、農業と環境161号
http://www.naro.affrc.go.jp/archive/niaes/magazine/161/
- 岡田浩明(2013)「統計学や数学が苦手な人に紹介したい参考書」、どろのむし通信No.58、18-20.
- 岡田浩明(2013)「第52回アメリカ線虫学会定期大会に参加して」、日本線虫学会ニュースNo.60、7-9.
- 岡田浩明(2013)書評「生態学のための数理的方法 考えながら学ぶ個体群生態学」、日本線虫学会ニュース第58号、P.13-14.
- 岡田浩明、大場広輔、竹本周平(2013)第3章土壌線虫の多様度分析技術の開発、土壌微生物相の解明による土壌生物性の解析技術の開発(eDNAプロジェクト)、研究成果第494集(全153ページのうちのp.33-40)、農林水産技術会議事務局発行.
- 岡田浩明 (2012) 市民農園・家庭菜園のための研究ができないか?こんなことが、いま、土と微生物、66, 1, P.38.
- 金田哲・岡田浩明 (2010)土壌小動物多様性への畑栽培管理の影響 農林水産技術研究ジャーナル, 33, 9, 31-35.
- 大場広輔・岡田浩明(2010)T-RFLP法による土壌生物群集の多様性解析 土と微生物, 64, 1, 41-48.
- 橋本知義・浅川晋・村瀬潤・島野智之・高橋忠夫・岡田浩明・佐藤恵利華・豊田剛己 (2009) 原生生物や線虫からみた土壌生態系の解明と活用 日本土壌肥料学会誌 80, 201-206.
- Okada, H., Morimoto, S., Hoshino-Takada, Y. (2008) Manual of microbial and nematode community analysis using soil DNA. NIAES Annual Report 2008, 12-14.
- 岡田浩明、森本 晶、星野(高田)裕子(2009)土壌DNAによる土壌生物相解析マニュアルの作成. 農環研ニュース、No. 81、 5-6.
- 岡田浩明 (2008) 土壌線虫群集の構造におよぼす有機農法の影響評価, (独)農業・食品産業技術総合研究機構、中央農業総合研究センター編集、交付金プロジェクト研究「有機農業の土壌環境への影響評価と環境保全効果の検証」成果集p.34-37.
- 岡田浩明、森本 晶、星野(高田)裕子(2007)土壌DNAによる土壌生物相解析マニュアルの作成. 農業環境技術研究所年報No.25(平成19年度)、7-9.
詳細は http://www.naro.affrc.go.jp/archive/niaes/project/edna/edna_jp/index.html.
- 岡田浩明 (2008) 群集類似度推定におけるDGGE法と形態同定法との比較. 植物防疫 62, 585-589.
- 森本 晶、星野(高田)裕子、岡田浩明 (equal contributor) (2008)土壌DNAによる土壌生物相解析マニュアル.農業環境技術研究所 平成19年度研究成果情報第24集、10-11.
- 大場広輔・岡田浩明 (2008)PCR-DGGE法による土壌生物群集解析法 (2)土壌線虫相の解析. 土と微生物 62, 69-73.
- 岡田浩明 (2007) 線虫群集を利用して土壌の健康度を評価する. 化学と生物 45巻1号、43-50.
- Okada, H. (2006) Application of ecological indices to the evaluation of nematode community changes after soil fumigation. NIAES Annual Report 42-43.
- 岡田浩明 (2005) 土壌生態系を評価するための線虫群集指数. 植物防疫. 59. 423-426.
(著書)
- 岡田浩明 (2014) 「第1部線虫の分類・同定法、第1章標本作製、7.群集研究用集合標本(p.15-p.16)、「第2部生理・生化学的研究法、第4章実験材料線虫の入手法・培養法・保存法、7.非寄生性線虫の培養法U-糸状菌食性線虫の培養(p.113)」、「第3部生態学的研究法、第11章線虫の群集生態学的研究法、1.線虫群集の指数化(p.217-p.222)」, 線虫学実験, 京都大学学術出版会.
- 藤井毅,星野(高田)裕子,森本晶,岡田浩明,對馬誠也(2010)第5章農業 1. 農耕地土壌の生物学的特性解明への挑戦. In 服部正平監修、「メタゲノム解析技術の最前線」、シーエムシー出版、東京、p.231
- 岡田浩明(2009)第1章 土壌生息性の原生生物と線虫、II 線虫 In 橋本知義ら編集「土壌肥料学会シンポジウムシリーズ「土壌の原生生物・線虫群集-その土壌生態系での役割-」, p.31-43. 2009年9月1日, 博友社, 東京
- 岡田浩明(2009)第2章 原生生物や線虫からみた土壌生態系の解明と活用、IV 線虫群集指数による土壌生態系の診断 In 橋本知義ら編集「土壌肥料学会シンポジウムシリーズ「土壌の原生生物・線虫群集-その土壌生態系での役割-」, p.115-131. 2009年9月1日, 博友社, 東京
(主な所属学会)
日本線虫学会、 日本土壌動物学会、 日本土壌微生物学会、 日本応用動物昆虫学会、 米国線虫学会、 欧州線虫学会