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Selexと略される試験管内選択系を用いてランダム配列を有する約100塩基長のRNA集団から、抗体のように特定の標的分子に結合する機能を有したRNA分子(RNAアプタマー)を取得し、それを利用して新規のRNA型の酵素阻害剤を開発した。 標的分子はタンパク質工学のモデル分子として知られる枯草菌由来のアルカリ性セリンプロテアーゼであるスブチリシン(subtilisin BPN’)を用いた。 Selexではランダム配列を有するDNA集団を出発点として転写反応の鋳型として用い、選択系ではセファロースカラムに固定化した酵素に対して結合能を有するRNAを取得し、再度逆転写PCRによってDNA化するという操作を８回繰り返した。 この操作によって得られたDNA集団をベクターを用いたクローニング操作によって単離し、更に各クローンの転写産物であるRNAにおいて標的であるスブチリシンに対して酵素活性を指標として阻害能力を有するものを選択した。 得られたRNAアプタマーはスブチリシンの酵素活性に対して2.5μＭの阻害定数を示した。 また、他のセリンプロテアーゼであるトリプシンやキモトリプシンに対しては阻害活性は示さず、スブチリシンに対して特異性が高いことを確認した。